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Les pôles régionaux de l’ISCC ont pour vocation de favoriser les collaborations, dans une zone géographique donnée, entre laboratoires, équipes de recherche ou chercheurs souhaitant apporter à leurs travaux une approche interdisciplinaire. Ils concernent les unités du CNRS ainsi que les entités universitaires ou privées.
Placés sous la responsabilité d’un chercheur associé à l’ISCC, ils inscrivent leurs activités dans le cadre des cinq domaines de recherche de l’Institut. Leur structure, leurs programmes de recherche respectifs sont adaptés aux ressources, aux effectifs et aux conditions locales de la recherche en région.
Cette structuration plurisdisciplinaire et délocalisée répond au 11e objectif — « Une organisation en instituts et en réseaux » — du Plan stratégique du CNRS à l’horizon 2020 :
« Pour une meilleure synergie des opérateurs de terrain, le CNRS se réorganisera selon une logique d’Instituts avec une double fonction d’agence et d’opérateur, et de réseaux pluridisciplinaires et délocalisés, capables de se mobiliser pour faire face aux grands enjeux scientifiques. »
Elle s’inscrit dans l’un des trois pôles d’intégration interdisciplinaire définis dans le cadre du plan stratégique, celui consacré à la société en réseau : « cognition et cerveau, communication, STIC, calcul de haute performance, très grandes bases de données ».
Deux pôles ont été créés en 2008, le pôle Aquitaine et le pôle Méditerranée. Le pôle Rhône-Alpes est fonctionnel depuis 2011. Un pôle Bretagne et un pôle Midi-Pyrénées sont en cours de création. L’ISCC travaille également à la mise en place d’un pôle International s’appuyant sur l’espace de la Francophonie.